潔凈室定義是特殊的房間，該房間內的空氣懸浮粒子濃度、空氣溫度、濕度、壓力等參數均需要控制。并且它應有減少粒子的誘入、產生及滯留之功效。這就需要通過良好的氣流組織，加之有效的壓差控制，符合工藝要求的潔凈室形狀及裝修材料，嫻熟的施工技術，科學的運行管理等各方面的共同作用來實現。
潔凈室按用途主要是分為工業潔凈室和生物潔凈室兩類；工業潔凈室主要是控制無生命的微粒對操作對象的污染；生物潔凈室除了控制無生命的微粒之外，還需針對有生命的微粒進行控制。常見的生物潔凈室應用在制藥企業、食品行業、醫療器械化妝品行業，醫療單位及相關科研教學實驗等；
生物潔凈室因涉及領域與人們身體健康相關，因此建設的標準與工業潔凈室相比要更加嚴格。除基本的《潔凈廠房設計規范》之外，以醫藥為例，還需參照《醫藥工業潔凈廠房設計規范》、《GMP藥品生產質量管理規范》等。在GMP中規定了藥品等生產車間的空氣潔凈度標準；
在表中可知，生物醫藥潔凈室不僅僅要求了空氣的潔凈度，更對室內的微生物也有規定和要求。因此在生物醫藥潔凈室的建造中，除正常的凈化機組循環過濾空氣以外，還需增加專業的滅菌設備。選用的機組設備及建造材料也要能面對滅菌時環境的腐蝕和破壞。
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